EC運営代行・コンサルティング会社80社を徹底比較!特徴・実績・選び方まで完全ガイド

この記事ではネットショップの運営を代行してくれるネットショップの運営代行会社のメリットや代行出来る業務内容 メリットなどを解説します。
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商品を預けるだけで手間なく簡単に楽天市場で商品の販売が出来ます。維持コストが高い楽天市場で商品の販売ができ、新たな収益が見込めます。サイト運営は弊社で行うため新たに人員を雇う必要がなく、商品と商品情報を送るだけで販売スタートできます。

EC運営代行とは、ECサイト(ネットショップ)の運営業務を専門会社に委託するサービスです。楽天市場、Amazon、Yahoo!ショッピングなどのECモールや、Shopifyなどで構築した自社ECサイトの運営に必要な様々な業務を、プロフェッショナルが代行・支援します。

人手不足の解消、専門知識の活用、売上拡大、業務効率化など、企業が抱えるEC運営の課題を解決することを目的としています。

近年、EC市場の急速な拡大により、多くの企業がEC事業に参入していますが、ECサイトの運営には商品登録、在庫管理、受注処理、顧客対応、マーケティング、データ分析など、多岐にわたる専門知識とリソースが必要です。

EC運営代行会社は、こうしたEC運営に関する豊富な経験とノウハウを持っており、自社でEC運営体制を構築するよりも、効率的かつ効果的にEC事業を成長させることができます。

EC運営代行が注目される背景

EC市場の急速な成長

日本のBtoC-EC市場規模は年々拡大しており、2024年には20兆円を超えると予測されています。コロナ禍以降、オンラインショッピングの利用が一般化し、EC事業への参入や強化が企業の重要戦略となっています。

EC運営の複雑化・専門化

各ECモールのアルゴリズム変更、SEO対策、広告運用、SNSマーケティングなど、EC運営に求められる知識とスキルは高度化・専門化しています。

人材不足とコスト効率

EC運営の専門人材を社内で確保・育成するには時間とコストがかかります。EC運営代行を活用することで、即戦力の専門家チームを活用できます。

EC運営代行導入のメリット

✓ 即戦力の専門家チームが活用できる
✓ 自社でEC人材を採用・育成する時間とコストを削減
✓ 最新のEC運営ノウハウとツールを活用できる
✓ 本業に集中しながらEC事業を拡大できる
✓ 柔軟に業務範囲やサービスレベルを調整できる

EC運営代行のタイプ別分類

EC運営代行会社は、その専門性やサービス提供方法によっていくつかのタイプに分類できます。自社のニーズに合ったタイプの会社を選ぶことが、EC事業成功の鍵となります。

総合支援型

ECサイトの戦略立案から制作・集客・物流・分析まで、EC運営に関わる全ての業務を一括してサポートするタイプです。広告代理店のような役割も担い、大規模プロジェクトに対応できる体制を持っています。

主な対応業務:

  • ECサイト制作・リニューアル
  • マーケティング戦略立案
  • 広告運用(Google・SNS・モール広告)
  • コンテンツ制作(商品ページ・LP・動画)
  • 物流・フルフィルメント
  • カスタマーサポート
  • データ分析・コンサルティング

向いている企業:

  • 大企業や売上規模の大きいEC事業者(年商1億円以上)
  • EC運営のノウハウが全く無い企業
  • 立ち上げから運営まで全てを任せたい企業
  • 複数チャネル(楽天・Amazon・Yahoo!・自社EC)を統合管理したい企業

費用目安: 月額50万円~300万円以上(売上規模や業務範囲により変動)

メリット: 一社で完結するため窓口が一本化され、連携がスムーズ。戦略から実行まで一貫したサポートが受けられる。

デメリット: 費用が高額になりやすい。小規模事業者には過剰サービスとなる可能性。

運営特化型(実務代行メイン)

日常的な運営業務(受注処理・在庫管理・顧客対応など)に特化したタイプです。既にECサイトが稼働しており、日々の実務負担を軽減したい企業に最適です。

主な対応業務:

  • 受注管理・処理
  • 在庫管理・発注補助
  • 商品登録・更新
  • カスタマーサポート(メール・電話対応)
  • レビュー管理
  • 基本的なページ更新作業

向いている企業:

  • 中小企業・個人事業主(年商数千万円~1億円規模)
  • 既にECサイトを運営しており、日常業務の負担を減らしたい企業
  • マーケティングは自社で行い、運営実務のみ外注したい企業
  • 人手不足に悩む企業

費用目安: 月額10万円~50万円

メリット: 比較的低コストで導入可能。コア業務(商品開発・戦略立案)に集中できる。

デメリット: 戦略立案や高度なマーケティングは含まれないため、売上拡大施策は自社で行う必要がある。

作業処理特化型(個別業務アウトソース)

特定の業務のみをピンポイントで外注するタイプです。「商品登録だけ」「広告運用だけ」「物流だけ」など、細分化された業務を必要に応じて委託できます。

主な対応業務(個別選択可能):

  • 商品撮影・画像加工
  • 商品登録作業
  • 広告運用(Google広告・SNS広告・楽天RPP・Amazon広告など)
  • 物流・梱包・発送
  • コンテンツ制作(ライティング・動画制作)
  • SNS運用代行
  • データ入力作業

向いている企業:

  • スタートアップ・小規模事業者
  • 自社でEC運営の大半を行っているが、特定業務のみ外注したい企業
  • 繁忙期のみスポット的にサポートが必要な企業
  • コストを最小限に抑えたい企業

費用目安: 月額5万円~30万円(業務内容により変動、スポット依頼も可能)

メリット: 必要な業務だけを選べるため無駄がない。小予算でもスタート可能。

デメリット: 複数業者に依頼する場合、管理の手間が増える。業務間の連携が取りにくい。

コンサルティング型(戦略支援メイン)

実務代行ではなく、戦略立案・改善提案・データ分析などのコンサルティングに特化したタイプです。自社で運営体制がある企業が、専門家のアドバイスを受けて売上を最大化したい場合に適しています。

主な対応業務:

  • EC戦略立案・事業計画策定
  • 市場調査・競合分析
  • 売上分析・KPI設定
  • マーケティング施策の提案
  • サイト改善提案(UI/UX・CVR向上)
  • 定期的なミーティング・レポート提出
  • 社内チームの育成・教育

向いている企業:

  • 既にある程度の売上があり、さらなる成長を目指す企業(年商1億円以上)
  • 社内にEC運営チームがあるが、専門知識が不足している企業
  • 戦略的なアドバイスが欲しい企業
  • 長期的な視点でEC事業を強化したい企業

費用目安: 月額20万円~100万円(コンサルタントのレベルや支援範囲による)

メリット: 高度な専門知識を活用できる。社内にノウハウが蓄積される。

デメリット: 実務は自社で行う必要がある。即効性よりも中長期的な成果を求められる。

EC運営代行を利用すべき企業の特徴

以下のような課題や状況にある企業は、EC運営代行の活用を検討する価値があります。

EC運営のノウハウ・リソースが不足している企業

  • 初めてECサイトを立ち上げる企業で、何から始めればよいか分からない
  • 実店舗は運営しているが、オンライン販売の経験がない
  • 社内にECやデジタルマーケティングの知識を持つ人材がいない
  • 過去にEC運営を試みたが、うまくいかなかった

なぜ代行が有効か:

EC運営には、サイト構築・SEO・広告運用・SNS活用・データ分析など、多岐にわたる専門知識が必要です。これらを全て自社で習得するには膨大な時間とコストがかかります。経験豊富なプロに任せることで、短期間で効果的な運営体制を構築できます。

おすすめのタイプ: 総合支援型、コンサルティング型

人手不足・リソース不足に悩んでいる企業

  • EC運営担当者が他業務と兼任しており、手が回らない
  • 商品登録・受注処理・顧客対応などの日常業務に追われている
  • 繁忙期(セール期間・年末年始など)に対応しきれない
  • 採用コストをかけずにEC運営体制を強化したい

なぜ代行が有効か:

EC運営には、受注処理や在庫管理、顧客対応など、ルーティン業務が多く発生します。これらを外部に委託することで、社内チームは商品開発・戦略立案・ブランディングなどのコア業務に集中できます。結果として、事業全体の生産性が向上します。

おすすめのタイプ: 運営特化型、作業処理特化型

 売上が伸び悩んでいる企業

  • ECサイトを運営しているが、アクセス数・売上が思うように伸びない
  • 広告を出しているが、費用対効果が悪い
  • 商品ページの改善方法が分からない
  • 競合他社に後れを取っていると感じる

なぜ代行が有効か:

売上が伸びない原因は多岐にわたります(集客不足、商品ページの訴求力不足、価格戦略のミス、ターゲット設定の誤りなど)。専門家による客観的な分析と改善提案により、ボトルネックを特定し、効果的な施策を実行できます。特に、広告運用・SEO対策・ABテストなどの専門分野では、プロの知見が大きな差を生みます。

おすすめのタイプ: コンサルティング型、総合支援型

複数チャネルを運営している企業

  • 楽天・Amazon・Yahoo!・自社ECなど、複数のプラットフォームで販売している
  • 各モールの仕様やルールの違いに対応しきれない
  • 在庫情報がバラバラで、管理が煩雑になっている
  • チャネルごとに戦略を最適化したい

なぜ代行が有効か:

複数チャネルの運営は、各プラットフォームの特性を理解し、それぞれに最適化した戦略が必要です。また、在庫管理や受注処理の一元化も重要です。経験豊富な代行会社は、複数モール運営のノウハウとシステム連携の技術を持っており、効率的な運営体制を構築できます。

おすすめのタイプ: 総合支援型

事業拡大・新規チャネル開拓を目指す企業

  • 自社ECを新たに立ち上げたい(現在はモール出店のみ)
  • 越境EC(海外販売)に挑戦したい
  • D2C(Direct to Consumer)ブランドを立ち上げたい
  • 新しい販路(Shopify・BASEなど)を試したい

なぜ代行が有効か:

新規チャネルの開拓には、市場調査・戦略立案・システム構築・マーケティング施策など、多くの準備が必要です。失敗するリスクを最小限に抑えつつ、スピード感を持って展開するには、豊富な実績を持つ代行会社のサポートが不可欠です。特に越境ECでは、現地の法規制・物流・決済手段など、専門知識が必須となります。

おすすめのタイプ: 総合支援型、コンサルティング型

コスト削減・効率化を図りたい企業

  • 社内でEC運営チームを持つコスト(人件費・教育費)を削減したい
  • 物流コスト・広告費を最適化したい
  • 業務の属人化を解消し、組織として効率化したい
  • 固定費を変動費化して、柔軟な経営体制を作りたい

なぜ代行が有効か:

社内でEC運営チームを持つ場合、人材採用・教育・システム導入など、初期投資と固定費が高額になります。一方、代行サービスは必要な業務だけを選んで委託できるため、無駄なコストを削減できます。また、成果報酬型の料金体系を選べば、売上に応じた支払いとなり、リスクを最小化できます。

おすすめのタイプ: 運営特化型、作業処理特化型(成果報酬型)

専門分野に特化した支援が必要な企業

  • 広告運用のみプロに任せたい(Google広告・SNS広告・楽天RPPなど)
  • 商品撮影・画像制作だけ外注したい
  • 物流・梱包・発送業務のみアウトソースしたい
  • カスタマーサポート業務を24時間体制にしたい

なぜ代行が有効か:

全てを委託する必要はなく、自社が苦手な分野・専門性が求められる分野だけをピンポイントで外注することも可能です。例えば、広告運用は高度な知識と継続的な最適化が必要なため、プロに任せることで費用対効果を大幅に改善できます。

おすすめのタイプ: 作業処理特化型

売る倉庫なら預けるだけで
楽天市場で商品の販売ができます。

商品を預けるだけで手間なく簡単に楽天市場で商品の販売が出来ます。維持コストが高い楽天市場で商品の販売ができ、新たな収益が見込めます。サイト運営は弊社で行うため新たに人員を雇う必要がなく、商品と商品情報を送るだけで販売スタートできます。

EC運営代行会社80社完全リスト

以下、各社の公式サイト、事業内容、主なサービス、実績を詳しくご紹介します。

大手・総合EC支援企業(1-10)

No.1

株式会社いつも

https://itsumo365.co.jp/

事業内容:EC・D2C事業の総合支援、ブランドメーカーへのEC戦略立案から実行支援まで

主なサービス:ECサイト運営代行、楽天・Amazon・Yahoo対応、EC構築、広告運用

実績:延べ12,000件以上のEC支援実績、中小企業から大手メーカーまで幅広く対応

No.2

サヴァリ株式会社

https://savari.jp/

事業内容:EC・D2Cのモール運用代行、楽天・Amazon・ヤフーショッピング対応

主なサービス:ECサイト運営代行、ECコンサルティング、Web制作、広告運用、越境EC支援

実績:3,000店舗以上のサポート実績、平均売上238%UP、契約継続率常時90%以上

No.3

トゥルーコンサルティング株式会社

https://www.top1-consulting.com/

事業内容:経営コンサルティング視点からのEC支援、楽天・Amazon運用代行

主なサービス:ECコンサルティング、運営代行、経営戦略支援

実績:多数のEC事業者支援実績、経営視点でのコンサルティングが強み

No.4

株式会社ピュアフラット

https://pureflat.co.jp/

事業内容:ECマーケティング支援、楽天・Amazon・Yahoo・Qoo10対応

主なサービス:ECサイト運営代行、広告運用、コンサルティング、データ分析

実績:3,000店舗以上の支援実績、平均372%の売上アップ率

No.5

株式会社ネイビーグループ(NAVY)

https://navygroup.co.jp/

事業内容:ECモール全般と自社広告運用に特化したワンストップEC支援

主なサービス:楽天・Amazon・Yahoo・Qoo10・TikTokなど各チャネル支援、D2C立ち上げ

実績:EC運営・構築・物流・広告の一気通貫サポート、多数のクライアント支援

No.6

アートトレーディング株式会社 (Art Trading Co.,LTD)

https://art-trading.co.jp/

事業内容:ECサイト制作、管理、運営代行、物流。EC事業をトータルでサポート

主なサービス:Shopif制作、運営支援、フルフィルメント、EC物流システム「mylogi」の提供

実績:15年以上の実績、200社以上のEC運営支援実績

No.7

しるし株式会社

https://shirushi.co.jp/

事業内容:ブランド戦略に基づいたECモール運営サポート

主なサービス:ECモール運用代行、コンサルティング、戦略立案から実行・データ分析まで一貫支援

実績:売上高902百万円、設立2021年、急成長中のEC支援企業

No.8

株式会社Proteinum(プロテーナム)

https://proteinum.co.jp/

事業内容:ECコンサルティング・運営代行、楽天・Amazon・Yahoo・自社EC対応

主なサービス:戦略立案、Webデザイン、マーケティング、ECサイト立ち上げから販促まで

実績:多数のEC事業者支援、サービス詳細や具体的な実績データは公式サイト参照

No.9

FORCE-R株式会社

https://force-r.co.jp/

事業内容:顧客目線のECコンサルティングと実行支援で売上最大化

主なサービス:EC運用代行、広告運用、SEO対策、ページ制作、Amazon・楽天支援

実績:3大モール全対応、Amazon売上3倍や、楽天売上2倍などの成長実績あり

No.10

株式会社ワンプルーフ

https://www.one-proof.co.jp/

• 運用リソースが不足している企業に対し、人材不足の課題を解決しながらEC事業の運営全般を代行・支援するサービスです。

• 自社ECサイトに加え、Amazon、楽天市場、Yahoo!ショッピングなどの主要モールや、広告・SNS運用・SEO対策など幅広い領域をカバーしています。

• 単なる作業代行にとどまらず、熟練のコンサルタントが「顧客目線」での戦略立案から実行支援までを横断的に行い、売上の最大化を目指す点が特徴です。

Shopify・越境EC専門企業(11-17)

No.11

株式会社飛躍(Hiyaku)

https://hiyaku-inc.com/

• ECサイトの構築からコンサルティング、実際の運用サポートまでを総括して提供し、事業の展開状況に合わせて多様なEC形態を提案できる点が特徴です。

• 「Shopify Plus Partner」としての知見を活かし、国内のEC運営代行にとどまらず、海外市場に向けた「越境EC運営代行」にも対応しています。

• サイト公開後も、売上拡大を目指す「グロースハックサポート」や、業務効率化を図る在庫連携アプリなどを通じて、継続的な販売支援を行います。

No.12

コマースメディア株式会社

https://commerce-media.info/

• ECサイトの構築から日々の運営、コンサルティング、物流、カスタマーサポートに至るまで、EC事業全体をワンストップで支援できる体制が整っています。

• 国内でも数少ない「Shopify Premier Partner」に認定されており、Shopifyに関する豊富な構築実績と高い専門知識を活かしたサポートが可能です。

• 自社ECサイトだけでなく、楽天やAmazonなどのモール運営にも精通しており、自社事業で培った実践的なノウハウを活用して対応できる点が特徴です。

No.13

nyMind Group株式会社

https://anymindgroup.com/ja

• ECサイトの構築・運用にとどまらず、商品開発(生産)、マーケティング、物流、カスタマーサポートまで、ブランドビジネスのバリューチェーン全体を一気通貫で支援します。

• 「AnyX(ECマネジメント)」や「AnyLogi(物流自動化)」、「AnyTag(インフルエンサー活用)」など、独自のテクノロジープラットフォームを駆使し、データを軸に収益向上と業務効率化を実現します。

• アジアを中心に15の国と地域に拠点を展開しており、越境ECや海外進出において、現地配送から販売戦略までを含めたグローバルな包括支援が可能です。

No.14

株式会社Rabo

https://r-abo.com/

• デジタルマーケティング事業で培った知見を活かし、単なる制作や運用だけでなく「マーケターの視点」からECサイトの売上拡大を支援する点が特徴です。

• Shopifyを活用したサイト構築に加え、売上の伸び悩むサイトを「売れるサイト」へと変貌させるリニューアルやリブランディングを得意としています。

• 検索やSNSなどの広告運用から、動画やランディングページ(LP)といったクリエイティブ制作までをワンストップで提供し、集客から販売までを一貫してサポートします。

No.15

株式会社ジェイグラブ(J-GRAB)

https://www.j-grab.co.jp/

• 国内のEC運営にとどまらず、海外市場への進出を専門とする「越境EC」に特化しており、3,000社以上の豊富な支援実績を持っています。

• 独自の委託販売型プラットフォーム「j-Grab Mall」でのテスト販売から始め、ShopifyやMagentoを用いた自社サイト構築、eBayやAmazonなどの海外モール展開へと、リスクを抑えて段階的に販路を拡大できる点が特徴です。

• サイトの構築や運営代行だけでなく、海外物流の手配や補助金・助成金の活用サポート、コンサルティングまで、海外ビジネス全体をトータルで支援します。

No.16

株式会社アプロ総研スタジオ

https://www.apro-soken.co.jp/

・ECサイトの立ち上げやリニューアルから、日々の運営、受注処理、カスタマーサポートまでをトータルで代行し、人手不足やリソース不足の課題を解決します。

・Shopifyエキスパート認定企業やフューチャーショップ認定マイスターとしての技術力に加え、10年以上の実績を持つ楽天運営代行など、各プラットフォームに特化した専門的な支援が可能です。

生成AIを活用したSNS広告運用や、閑散期のリスクを抑える従量課金制の「スモールコールセンター」など、最新技術や柔軟なプランで効率的な運営をサポートします。

No.17

JUTOU株式会社

https://ju-tou.net/

・中国をはじめ、台湾、韓国、東南アジア、欧米など世界各国への「越境EC」や海外進出支援に特化したプロフェッショナル集団です。

・ECコンサルティングにとどまらず、海外WEBマーケティングやSNS運用代行、BtoB支援まで、海外展開に必要なソリューションをトータルで提供します。

・10年以上にわたって培った業界ノウハウと自社事業での成功実績に基づき、机上の空論ではない「成果にこだわるマーケティング」を実践する点が特徴です。

ECプラットフォーム・システム提供企業(18-26)

No.18

GMOメイクショップ株式会社

https://www.makeshop.co.jp/

• ECサイトの構築支援だけでなく、売上拡大のためのマーケティング支援や、店舗運営に必要な業務を代行する「EC運用受託」まで、商取引事業の成長を幅広くサポートします。

• 決済フォーム一体型のLP作成ツール「LP Direct Order」やレビュー活用機能の強化など、コンバージョン率(購入率)向上やデータ活用を促進する機能開発に注力しています。

• 越境EC支援を行うジェイグラブ株式会社をグループ化しており、国内市場にとどまらず、海外市場への挑戦も強力に支援する体制を強化しています。

No.19

W2株式会社

https://www.w2solution.co.jp/

• 総合EC、リピート通販、BtoB、越境ECなど、あらゆるビジネスモデルに対応した業界トップクラスの多機能プラットフォームを基盤に、1,100社以上の導入実績を持っています。

• システムの提供にとどまらず、戦略立案からサイト構築、デザイン制作、コンサルティング、実際の運用定着まで、各分野の専門家が一気通貫で支援する体制が整っています。

• 生成AIを活用したパーソナライゼーションや、実店舗と連携するOMO、海外現地の物流・決済に対応した越境EC支援など、最新技術とトレンドを取り入れた拡張性の高さが特徴です。

No.20

株式会社ECBEING(イーシービーイング)

https://www.ecbeing.net/

• 国内市場で17年連続シェアNo.1を獲得しており、中堅・大手企業を中心に1,600サイト以上の構築実績とノウハウに基づいたトータルサポートを提供します。

• ECサイトの構築だけでなく「マーケティング運用支援」も行っており、BtoB、越境EC、オムニチャネル、モール構築など多様なビジネスモデルに対して柔軟なカスタマイズと運用支援が可能です。

• AIによるレコメンドやチャットボット、レビュー分析などの最新技術や、CRM・データ分析ツールを標準機能や拡張サービスとして備え、売上最大化に向けた戦略的な運営を強力に後押しします。

No.21

株式会社エスキュービズム

https://s-cubism.jp/

• ECサイト構築パッケージ「EC-ORANGE」やPOSシステム等のプロダクト提供を軸に、リテール企業のDXやオムニチャネル化を技術面から強力に支援します。

• 2006年の創業以来、EC構築を起点に多様な業種のビジネスに伴走しており、システム開発にとどまらない根本的な課題解決と独創的なソリューション提供を掲げています。

• アパレルソリューション事業では自らブランド運営を行うなど、実業を通じて培ったノウハウとITを組み合わせ、顧客企業の成長を実践的にサポートできる点が特徴です。

No.22

株式会社インターファクトリー

https://www.interfactory.co.jp/

• エンタープライズ企業におけるECサイト構築市場でシェアNo.1を獲得した「ebisumart」をはじめ、幅広いターゲット層の課題に対応するクラウドコマースプラットフォームを提供しています。

• 「ebisu growth」や「ebisu commerce」といったサービスも展開しており、システム提供を通じてコマースビジネス全体の進化とあらゆる課題解決を目指す姿勢が特徴です。

• Amazonや楽天市場などのモール攻略手法や、動画マーケティング、セール対策に関するセミナーを積極的に開催し、運営の成果に直結する最新ノウハウも提供しています。

No.23

株式会社SUPER STUDIO

https://www.super-studio.jp/

• 自らD2Cブランドを企画・運営することで得た知見や課題を開発にフィードバックし、徹底したユーザーファーストを追求するシステム「ecforce」を提供しています。

• AIなどの最先端技術を取り入れた「AIコマースプラットフォーム」として、データ活用や業務改善、マーケティング最適化など、コマースビジネス全体のDXを推進します。

• 単なるシステム提供にとどまらず、アパレルやガジェットなど多岐にわたる自社事業で培った実戦的なノウハウやデータを顧客に還元し、事業成長を本質的に支援する点が特徴です,。

No.24

株式会社コマース21

https://www.commerce21.co.jp/

• 顧客体験価値の創造を通じて消費者をロイヤルカスタマー化し、LTV(顧客生涯価値)向上を実現する独自の「ロイヤルカスタマーDXソリューション」を提供しています。

• 企業専属の「技術コンサルティング」として、初期の要件定義からシステム構築、リリース後の運用保守までをワンストップでサポートする体制が整っています。

• 国内EC売上TOP100社のうち12社、大規模EC300社超への導入実績を持ち、ビジネスのバリューチェーン全体を分析して高付加価値を生み出す提案力が特徴です。

No.25

株式会社ブランジスタ

https://solution.brangista.com/

• 2,000社以上のECサイト運営実績に基づき、ページ制作や販促企画といったフロント業務から、物流、受注処理、カスタマーサポートなどのバックヤード業務までをトータルで支援します。

• 「TikTok Shop」の公式パートナーとして認定されており、5.4億人超のクリエイター網や香港現地法人を活用して、アジア諸国への越境ECや動画マーケティングを強力に推進しています,。

• 楽天RMS正式パートナー認定の受注・在庫一元管理ツール「EC店長」を提供しており、多モール展開における業務効率化を実現し、流通額400億円以上の実績を支えています。

No.26

株式会社Eストアー

https://estore.jp/

• 25年にわたるD2C専業の経験と3万サイト以上の支援実績を持ち、システム構築からマーケティング代行まで、リピート通販の成功に必要な要素をトータルで提供します。

• 「CRM運用代行」に強みを持ち、分析や戦略立案、メルマガ・SNS配信などの実務を通じて、新規獲得だけでなくLTV(顧客生涯価値)最大化とロイヤルカスタマー育成を強力に支援します。

• ECサイト制作や広告運用のほか、標準でCRM機能を備えたカートシステムやRPA(業務自動化)ツールの活用により、人手不足や集客といった経営課題を技術と運用の両面から解決します。

コンサルティング・マーケティング特化企業(27-40)

No.27

株式会社ECマーケティング

https://ecmarketing.co.jp/

• 「KPI達成率98%」や「売上UP累計377億円」という実績が示す通り、単なる作業代行ではなく、サイトリニューアルやUI改善を通じて顧客の目標達成にコミットする「課題解決型」の支援を行います。

• ECサイトの構築だけでなく、集客(広告・SEO)、接客(UI/UX・ツール)、追客(CRM)の全フェーズに対応し、戦略策定から運用代行までを一気通貫でサポートする体制があります。

• Webマーケティングの内製化支援やコンサルティングも提供しており、アパレル、食品、家電など500社以上の幅広い業種において、CVR向上や売上最大化を実現しています。

No.28

株式会社マクロジ

https://maclogi.co.jp

• コンサルティングと運営代行をワンストップで提供し、戦略立案から配送・人員配置の効率化まで踏み込むことで、売上拡大だけでなく利益最大化と目標達成のスピードアップを実現します。

• 楽天市場やAmazonなどのモール運営から自社EC(D2C)まで幅広く対応し、モバイルファーストな「売れる」ページ制作や、SNS・インフルエンサーを活用した集客施策に強みを持っています。

• 「半年で月商1,000万円」といった豊富な成功実績に加え、人手不足の企業向けに低単価でスタートできる業務代行プランも用意されており、企業のフェーズに合わせた柔軟な支援が可能です。

No.29

株式会社マイステーション

https://www.mystation.co.jp/

• デジタルマーケティング領域に強みを持つ総合経営コンサルティング会社として、単なる運用代行にとどまらず、売上アップに直結するKPI設計や事業構造の再定義から徹底的にサポートします。

• Google、Meta、LINEなどのデジタル広告運用の最適化を得意とし、実務経験に基づく再現性の高い支援によって、集客改善や企業の成長スピード加速を実現します。

• 事業戦略の立案から実行支援、さらにはM&Aや事業承継までを一気通貫で手掛けており、マーケティング改善のみならず、経営課題全体を包括的に解決できる点が特徴です。

No.30

株式会社PIC

https://pic-c.co.jp/

• Amazonや楽天市場などの主要モールから自社ECサイトの立ち上げまで、戦略構築・運営代行・広告運用・サイト制作をワンストップで包括的に支援します。

• 累計支援社数500社以上、継続率98%以上という高い実績を誇り、カテゴリートップ企業を50社以上創出するなど、確かな成果でクライアントの成長を支えます。

• 短期的な収益よりも「長期的な利益」を重視するパートナーとして伴走し、大手だけでなく地方中小企業の支援や食品ジャンルなど幅広い領域で強みを発揮します。

No.31

GIVE&GIVE株式会社

https://g-give.co.jp/

• 自社ECからAmazon・楽天などのモールまで対応し、社内の専門スタッフが戦略立案から実務、分析改善までをワンストップでサポートする「伴走型」の支援を行います。

• 物流、撮影、薬機法対応などに特化した専門企業と連携しており、サイト制作や運営だけでなく、ブランディングや化粧品等の商品開発(D2C)まで一気通貫で支援可能です。

• 「ECに魔法はない」という信念のもと、週1回の定例ミーティングでプロジェクトを管理してスピーディーにPDCAを回し、企画から日々の地道な運営までEC事業の根幹を支えます。

No.32

NE株式会社

https://consulting.ne-inc.jp/

• 「EC支援企業のBEST100」ECコンサル部門での受賞実績を持ち、豊富なデータとノウハウを基に、楽天・Yahoo!・Amazonから自社サイトまで最適な施策を提案・実行します。

• 運営代行やコンサルティングに加え、TikTok Shop運営支援や生成AI活用講座など最新トレンドにも対応し、広告運用から受注・CS対応まで幅広くサポートします。

• 「EC市場に革命を」というミッションのもと、高品質なコンサルティングサービスをリーズナブルな価格で提供し、多くの選択肢から顧客に合わせた最適解を導き出します。

No.33

株式会社arounds(アラウンズ)

https://www.arounds.co.jp/

• 専属ディレクターと各分野の専門スタッフがチームを組み、クライアントごとに独自の「売れる仕組み」を設計・実行して課題解決を導きます。

• EC・WEB領域での実績は17年におよび、取引社数500社以上、運営継続率85%(2022年度実績)という豊富な経験と高い信頼性を誇ります。

• 単なる制作や運営だけでなく、課題の洗い出しから施策の実行・検証を繰り返すことで、最新技術の実装や効果的な運用体制を確立します。

No.34

株式会社ロルエージェント

https://www.lolagent.jp/

• 楽天市場での運営実務20年以上の経験を持つ専門家が、戦略立案からページ制作、RMS操作やバックオフィス業務まで、「売れる基本運営」を徹底的にサポートします。

• 単なる代行にとどまらず、データ解析から課題を特定する「1DAYコンサルティング」やスタッフ教育を通じて、店舗が自走し成長し続けるための体制づくりを支援します。

• 顧客心理やトレンド分析に基づいた「売れる」ページ構成やメルマガ改善により、月商約62倍の売上拡大や開封率70%超といった具体的な成果を実現しています。

No.35

株式会社ジャグー

https://jagoo.co.jp/

• 「楽天ショップ・オブ・ザ・イヤー」などの受賞実績を豊富に持つEC事業の精鋭が集結し、戦略立案から運用・分析までをプロフェッショナル視点で総合的に支援します。

• 単なる作業代行にとどまらず、売上拡大や利益の最大化、さらにはEC事業の組織化まで踏み込んで「実行」し、企業の継続的な成長を後押しします。

• 楽天市場・Yahoo!・Amazonなどの主要モールや自社サイト制作に対応し、市場シェア7倍や売上5倍といった具体的な成果創出に向けたマーケティング施策を提供します。

No.36

株式会社Wacworks

https://wac-works-ec.jp/

• 売上アップ率200%以上・契約継続率95%という高い実績を持ち、データ分析に基づいた戦略で、月商0円から1,650万円への急成長など確実な成果を創出します。

• 日本一のEC特化型動画メディア「ECグロースチャンネル」を運営して常に最新ノウハウを発信しており、各モールのアルゴリズムから逆算した「勝利の方程式」で売上最大化を支援します。

• 施策内容や期間を契約前に明確にする「クリアなコンサルティング」を徹底し、楽天・Amazon・Yahoo!・Qoo10など多岐にわたるモールや自社ECの立ち上げから改善まで幅広く対応します。

No.37

エスアンドティーパートナーズ株式会社

https://stps.co.jp/

• 社名の由来である「Strategy(戦略)」と「Tactics(戦術)」を駆使し、4年で売上30億円という圧倒的な実績を持つトップクラスのECコンサルタントが総合支援を行います。

• 調査・分析などの上流工程からサイト制作・広告運用といった実務までをノンストップで提供し、楽天市場やAmazon、Shopifyなど幅広いプラットフォームとカートシステムに対応します。

• 業界を問わず1,000社以上の取引実績を誇り、運営代行における年平均成長率は140%以上と、顧客企業を確実に成長へ導く定量的な強みを持っています。

No.38

株式会社ALL WEB CONSULTING

https://allweb-consulting.co.jp/

• ECサイト・ネットショップ支援に特化したマーケティング会社として、戦略立案からサイト制作、集客、運営代行までをワンストップでトータルサポートします。

• 支援実績1,000サイト超、平均売上アップ率254%という圧倒的な実績を持ち、膨大なデータから導き出した「売れるノウハウ」で確実な成果を提供します。

• 楽天・Amazonなどのモールから自社ECまで対応し、SEO対策や広告運用、さらには最新のAI活用技術も駆使して「最短ルート」での売上拡大を実現します。

No.39

株式会社これから

https://corekara.co.jp/

事業内容:EC運営代行・コンサルティング

主なサービス:EC運営支援、戦略立案、実行サポート

実績:成果報酬型サービス提供

No.40

株式会社アッション

https://www.assion.co.jp/

事業内容:EC広告運用・マーケティング支援

主なサービス:広告運用代行、マーケティングコンサルティング

実績:多数の広告運用実績

その他専門特化企業(41-80)

No.41

株式会社ブランジスタ(ソリューション)

https://solution.brangista.com/

事業内容:ネットショップ・ECサイト運営総合サポート、ECサポートpro

主なサービス:制作・コンサルティング・Webマーケティング、楽天・Yahoo・Amazon・自社通販

実績:2000年設立、EC・通販企業支援の老舗、3000サイト・2000社超の実績

No.42

株式会社アイズプランニング(I’s Planning)

https://is-png.com/

事業内容:ECサイト運用、受注から発送代行まで一貫サービス

主なサービス:フルサポートプラン、楽天・Amazon等のECモール対応、フルフィルメント

実績:食品EC対応(4温度帯発送可能)、全国規模の物流ネットワーク

No.43

株式会社未来堂

https://www.miraido.jp/

事業内容:Eコマース事業、食品・酒類専門通販(FELICITY)

主なサービス:ECサイト運営、食の総合企業、安心安全・美味しさ追求

実績:全国のお客様に”おいしい”を届ける、スーパー・カフェなど事業拡大

No.44

株式会社ヘッドウォータース

https://www.headwaters.co.jp/

事業内容:AIソリューション事業、EC展開支援

主なサービス:ネット通販事業の計画から立ち上げ、運用、事業改善、AIソリューション

実績:DXサービス、プロダクト/サブスクリプション提供

No.45

株式会社マイステーション(My Station)

https://mystation.co.jp/

事業内容:ECモール店舗運営代行専門

主なサービス:Amazon・楽天市場・Yahooショッピング・Qoo10運営代行

実績:商材や商品数から店舗運営プラン策定、柔軟な対応

No.46

Limelight株式会社(ライムライト)

https://lime-light.co.jp/

事業内容:Qoo10特化EC運用代行

主なサービス:Qoo10出店代行、運営代行、ページ制作、広告運用

実績:2024年設立、Qoo10専門の販売支援サービス、急成長市場に特化

No.47

株式会社クロス・プロップワークス

https://www.propworks.co.jp/

事業内容:事業推進を加速させるBPO会社、EC運用支援

主なサービス:ECモール運用代行、マーケティングリサーチ×EC戦略、SNS運用代行

実績:定額制プラン、データドリブンな戦略立案

No.48

コマースロボティクス株式会社

https://commerce-robotics.com/

事業内容:受注・出荷・発注自動化サービス「コマースロボ」

主なサービス:ネットショップ運営、受注管理、倉庫管理、発注管理の自動化

実績:楽天公式グローバルパートナー認定、B2C/B2B/SCM/越境ECまで拡大

No.49

EC成長基盤株式会社

https://ecgp.co.jp/

事業内容:D2C・EC支援・ブランドの譲渡・売却

主なサービス:D2C/ECブランド支援、M&A、EC成長支援

実績:ECブランドの成長から事業承継まで総合支援

No.50

Finner株式会社

https://finner.co.jp/

事業内容:ECサイトアップグレード、コンサルティング、サイト制作

主なサービス:EC運営代行/支援、楽天・Amazon・Qoo10などマルチモール対応

実績:成果報酬・単月プランあり、ECコンサルティング専門

No.51

株式会社ECマーケティング

https://ecmarketing.co.jp/

事業内容:Webリニューアル・制作、ECマーケティング・コンサルティング

主なサービス:Webサイト制作・開発、マーケティング、Web・ECリニューアル

実績:課題解決型アプローチ、多数のリニューアル実績

No.52

ベイクロスマーケティング株式会社

https://www.baycross.jp/

事業内容:自社EC運営代行サービス、EC構築から運用・集客・分析まで

主なサービス:店舗戦略、EC運営支援、マーケティング

実績:総合的なEC支援実績

No.53

株式会社ザーナス(E-EM)

https://e-em.net/

事業内容:EC・ネットショップ運営代行・コンサルティング

主なサービス:楽天・Amazon・Yahoo・自社サイト運用、売上アップ支援

実績:830社超の支援実績、93%売上増加、91%顧客満足度

No.54

株式会社ショップアシスト

https://shop-assist.siaj.co.jp/

事業内容:EC運営代行、ECコンサルティング

主なサービス:EC運営支援、料金相場情報提供

実績:多数のEC事業者支援実績

No.55

株式会社GRIT(グリット)

https://grit-group.co.jp/

事業内容:マーケティング事業、ECサイト等デイリー管理業務代行

主なサービス:WEB広告、メディア事業、システム開発、EC運営代行

実績:デジタルマーケティングとEC運営を総合的にサポート

No.56

株式会社Epace(イーペース)

https://e-pace.co.jp/

事業内容:総合マーケティング、ECサイト制作・運営代行

主なサービス:Amazon・楽天支援、クリエイティブ制作、SNSマーケティング

実績:多様なECプラットフォーム対応、総合マーケティング支援

No.57

ごえん株式会社(GOEN INC)

https://goen-inc.com/

事業内容:ECサイト商品撮影・レタッチ・データ登録、ワンストップEC運営支援

主なサービス:EC運営代行、WEBサイト制作、物流、商品登録

実績:ECサイト管理の総合的サポート

No.58

トランスコスモス株式会社

https://www.trans-cosmos.co.jp/ec/

事業内容:ECワンストップサービス、日本・北米・中国展開

主なサービス:EC運用代行、EC店長パッケージ、Shopify構築、OMO、MA実装

実績:約200社のクライアント実績、大規模EC運営支援

No.59

BeeCruise株式会社

https://beecruise.co.jp/

事業内容:越境EC運営代行、国別戦略に強い

主なサービス:越境EC支援、海外市場進出サポート

実績:多国展開のEC支援実績

No.60

株式会社ECコンサルカンパニー

https://www.eccc.co.jp/

事業内容:ECコンサルティング、運営代行

主なサービス:日本・中国・東南アジアでのEC支援

実績:1,000件以上の支援実績、国際的なEC展開に強み

No.61

株式会社イー・ロジット

https://ec-bpo.e-logit.com/

事業内容:EC物流代行サービス、フルフィルメント

主なサービス:倉庫管理、在庫管理、発送代行、返品対応

実績:EC物流専門、多数の事業者支援実績

No.62

株式会社プラスアルファ・コンサルティング

https://www.pa-consul.co.jp/

事業内容:テキストマイニング技術でビッグデータ可視化、Mieruka Engine開発

主なサービス:データ分析、EC最適化、顧客分析ツール

実績:データドリブンなEC改善支援

No.63

GIVE&GIVE株式会社

https://g-give.co.jp/

事業内容:伴走型EC支援、自社EC・楽天・Amazon・Yahoo出店・運営

主なサービス:EC運営代行、コンサルティング、制作・運営サポート

実績:企画立案~施策実施~結果分析~改善をワンストップ支援

No.64

マーケティングパートナー株式会社

https://www.marketing-partner.jp/

事業内容:ECサイト構築・運営代行・フルフィルメント、広告運用特化

主なサービス:EC総合支援、デジタルマーケティング

実績:広告運用に強みを持つEC支援

No.65

しるし株式会社

https://shirushi.co.jp/

事業内容:ECモール運用代行・コンサルティング

主なサービス:Amazon・楽天市場の運用代行、戦略立案、データ分析、独自検知システムによるブランド保護

実績:ブランド戦略に基づくECモール運営支援、戦略から実行まで一貫支援

No.66

株式会社Proteinum

https://proteinum.co.jp/

事業内容:楽天・Amazon・Yahoo!ショッピング特化型EC支援

主なサービス:ECコンサルティング、運営代行、SEO対策、広告運用、サイト制作をワンストップで提供

実績:3部門でNo.1評価獲得、豊富な実績とシステム提供で総合サポート

No.67

株式会社ワンプルーフ

https://www.one-proof.co.jp/

事業内容:ECソリューション・運営代行総合支援

主なサービス:EC運営代行、サイト構築、コンサルティング、フルフィルメント、多店舗展開支援

実績:800社以上のEC事業者支援実績、2008年創業以来の豊富な経験

No.68

株式会社R6B

https://r6b.jp/

事業内容:Shopify専業エージェンシー

主なサービス:Shopify構築、Klaviyo導入支援、D2C・越境EC・B2B対応、アプリ開発

実績:547サイト超、Shopify Best Agency受賞3回、Platinum Partner認定

No.69

株式会社ファイブスプリングス

https://www.5springs.co.jp/

事業内容:楽天市場・Yahoo!ショッピング特化型支援

主なサービス:コンサルティング、運用代行、広告運用、制作代行、SEO対策

実績:400店舗以上の支援実績、楽天市場とYahoo!ショッピング専門

No.70

株式会社オタツー

https://ota2.jp/

事業内容:ECサイト制作・運営代行専門

主なサービス:ECサイト制作、定額運営代行、楽天市場開店代行、Shopify構築

実績:10年以上3000件以上の実績、Shopify公式認定パートナー

No.71

株式会社Lxgic

https://lxgic.org/

事業内容:Shopify特化型EC構築・運用支援

主なサービス:Shopify構築、SNS運用代行、インフルエンサーマーケティング、D2C支援

実績:Shopify Experts認定、最短2週間でのサイト構築が可能

No.72

フラッグシップ株式会社

https://flagship.cc/

事業内容:Shopify Plus・大規模EC専門

主なサービス:Shopify Plus構築、ECグロース支援、AIエンジニアリング、Mirakl導入

実績:Shopify Plusパートナー認定、エンタープライズEC特化

No.73

株式会社フルバランス

https://fbl.jp/

事業内容:Shopify専門EC構築・成長支援

主なサービス:Shopify構築、運用代行、マーケティング、売上拡大支援

実績:Shopify Partner of the Year 2024受賞、業界歴20年

No.74

株式会社ネットショップ総研

https://netshop-soken.co.jp/

事業内容:EC研究特化型運営代行・コンサル

主なサービス:EC運営代行、コンサルティング、戦略立案、広告運用、人材育成

実績:楽天MVP3年連続受賞、Yahoo!コマースパートナー認定

No.75

株式会社ウェブライフ

https://web-life.co.jp/

事業内容:Shopify構築・アプリ開発専門

主なサービス:Shopify Plus対応、高セキュリティCMS提供、運用支援、ECプランニング

実績:Shopify Platinumパートナー認定、200社以上の支援実績

No.76

NE株式会社(旧Hameeコンサルティング)

https://consulting.ne-inc.jp/

事業内容:ECコンサル・運営代行

主なサービス:楽天、Yahoo!ショッピング、自社ECの運営代行とコンサルティング

実績:契約継続率95%以上、EC業界相関図4年連続掲載

No.77

コマースメディア株式会社

https://commerce-media.info/

事業内容:Shopify Premier Partner

主なサービス:ECサイト制作・運営代行、Shopifyアプリ開発、楽天・Amazon・Yahoo!モール運営代行

実績:国内3社目のShopify Experts、Shopifyエバンジェリスト在籍

No.78

Recustomer株式会社

https://recustomer.co/

事業内容:購入体験プラットフォーム

主なサービス:お試し購入、予約注文、商品追跡、返品・交換・キャンセルの自動化

実績:購入体験向上と業務効率化を実現、決済から配送追跡まで総合支援

No.79

株式会社ニュートラルワークス

https://n-works.link/

事業内容:デジタルマーケティング総合支援

主なサービス:ECサイト制作、Shopify構築、SEO対策、広告運用、コンテンツマーケティング

実績:3,000社以上の実績、Shopify公式認定パートナー

No.80

株式会社セルフプラス

https://self-plus.co.jp/

事業内容:Shopify・ECサイト制作専門

主なサービス:Shopify構築、Ecforce構築、SEO対策、コンテンツマーケティング、広告運用

実績:Shopify Strategic Partner認定、納品最短1ヵ月、App Unityアライアンス参画

EC運営代行会社の選び際のポイント

自社に最適なEC運営代行会社を選ぶために、以下のポイントを確認しましょう。

  • 自社の課題と目的を明確にする
    売上拡大、業務効率化、人手不足解消など、何を実現したいのかを明確にしましょう。
  • 対応プラットフォームを確認
    楽天、Amazon、Shopifyなど、自社が利用するECプラットフォームに対応しているか確認しましょう。
  • 専門性と実績をチェック
    自社の業界や商材での支援実績があるか、具体的な成果事例を確認しましょう。
  • サービス範囲を確認
    必要な業務がすべてカバーされているか、部分委託が可能かを確認しましょう。
  • 料金体系を比較
    固定報酬型、成果報酬型、ハイブリッド型など、自社に合った料金体系を選びましょう。
  • コミュニケーション体制を確認
    担当者との連絡頻度、レポート提供の頻度、緊急時の対応体制を確認しましょう。
  • 内製化支援の有無
    将来的にEC運営を内製化したい場合、人材育成やノウハウ移転の支援があるか確認しましょう。
  • 複数社を比較検討
    最低3社以上から提案を受け、サービス内容・料金・相性を総合的に判断しましょう。

まとめ

EC運営代行は「コストをかける投資」です。「自社で何ができるか」「何を任せるべきか」を明確にし、費用対効果を見極めることが成功の鍵です。まずは無料相談を活用して、複数社を比較検討しましょう。

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売る倉庫編集部
売る倉庫編集部
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